Défendre les enjeux de la desserte maritime, des infrastructures portuaires et de la logistique ; promouvoir le développement de l'économie bleue (pêche, nautisme, croisière, énergies marines, aquaculture…) ; traiter les sujets environnementaux maritimes (sargasses, pollution, protection des littoraux…) ; porter les positions des entreprises ultramarines sur la réglementation maritime européenne.

Les Outre-mer représentent 97 % du domaine maritime national et 87 % de la biodiversité française. La commission œuvre au développement économique du secteur maritime dans le respect de l'environnement et la valorisation raisonnée de ses ressources.